ホーム画面の「その他」の「投稿済み小説コピー」で間違って投稿した第2部を「執筆中小説」にコピーできるので、それを第1部が入っている連載の方に「次話投稿」して下さい。
もしくは普通にパソコンの画面上で第2部の文書をコピペして新規小説作成から次話投稿でも大丈夫です。
「次話投稿」は執筆中小説にコピーしたものを開くか、新規小説作成の保存後の画面のどこかにボタンがあると思います。
間違って投稿した第2部はコピーしただけで消えていないので、そちらはあらすじに間違って投稿したものだと書いて検索除外にするか、削除して下さい。(検索除外や削除のやり方がわからない場合は、この質問板を検索すれば出てくると思います)