ログイン直後のページから、お気に入りのタブを開くと、ブクマ更新順の左に、非公開のリンクがあるので、それをクリックして下さい。

おそらく、あなたが利用しているのは“他のユーザーに公開されている”側でしょう。(公開側と仮称)

もう一つが、他ユーザーには非公開で、小説を書いたり編集したり出来る側。(作業側と仮称)

公開側のマイページでは、非公開に設定したデータ(ブックマークや、お気に入りユーザー等)は、見る方法がありません。

基本的に、ログイン時には作業側にアクセスする筈ですが、誤って公開側に端末のブックマークを行った場合は、一旦ログアウトしてから再度ログインするのが一般的でしょう。

マイページをブックマークしたURLの見分け方ですが、
「http://syosetu.com/user/top/」
が作業側で
『http://mypage.syosetu.com/361501/』(←私の場合)
が公開側です。
数字(IDナンバー)が入ってたら作業側ではない、と認識すれば良いかと。

ログイン状態で作業側のURLに跳べば、非公開のブックマークを確認できる筈ですので、確認してみてください。

お二人ともありがとうございました。
お返事が遅くなりすみません。
公開されている側になっていました。