PDF表示アプリやプラグインが縦書き表示に対応していないと一部の文字が正しく回転表示しません。

PDFを表示するのにアプリを使ってるのかプラグインを使ってるのかはわかりませんが、変更すれば正しく読める可能性があります。

私も同じ内容でかなり苦労しました。
結果、どうにもなりません。
firefoxなんですが、pdfビューアになったのが原因だと思います。
たぶん、私もとぴぬしさんも今まではadobeのアドオンを使用しての
縦書き利用だったと思われます。
ですが、firefoxが独自のpdfビューアを入れたため、このアドオンが使用できずに
（しかも私の能力ではもうこのアドオンを入れることはできませんでした）
縦書きが変になってしまうのです。

仕方ないので縦書きで読むにして一度展開してからダウンロード→adobereaderで読む　にすると、きちんとした縦書きになります。
ワンクッション手間が増えて面倒にはなりますが。

ほんとになんとかならんかなぁ。
誰か教えて！！

解決というか、上記より簡単な方法を発見しました。
ブラウザをＩＥに変えると一発で解決です。

おもしろそうな小説を発見したらＩＥへコピペしたらOKです。