接続障害が原因だったようです。
更新情報の反映が行われなかったということなので、メッセージの未読扱いもそのせいかと。
そろそろ直ってきたように思えますが、不具合の詳細は確認中のようです。

▼公式ブログ「小説家になろうグループ接続障害のお知らせ」
http://blog.syosetu.com/?itemid=724

▼【追記】小説家になろうメンテナンスのお知らせ
http://blog.syosetu.com/index.php?itemid=720

＞2013年2月7日 14時 30分
＞※メンテナンスは無事終了しました。ご協力ありがとうございました。
＞なお、2月7日午前より発生しております不具合の詳細につきましては、今しばらくお待ちいただけますようお願い致します。

ありがとうございます。
無事に直ってました(^-^*)
時間が解決してくましたね。
わざわざ返信ありがとうございます！